跨学科硕士论文在万方查重系统中的覆盖范围是非常广泛的。万方查重系统会检测论文中的文字、图片、表格等内容，同时还会对引用文献和参考资料进行比对。系统会检测各个学科领域的文献数据库，确保覆盖面尽可能广泛。因此，无论跨学科硕士论文的内容涉及哪些领域，都可以通过万方查重系统进行检测。

此外，万方查重系统还支持对跨语种的文献进行检测，可以识别不同语言的文本内容，包括中文、英文、日文等。这为撰写涉及多语种内容的跨学科硕士论文提供了便利。同时，万方查重系统还能够识别不同格式的文档，比如Word、PDF等，确保各种格式的论文都能够被系统检测到，保证查重结果的全面性和准确性。